医師が転職する方法として、一般的と言われているのが医局制度を活用する方法です。転職をしたい場合は、医局からの紹介を通じて、次の転職先を見つけます。簡単に医局の説明をすると、医局というのは大学でいうところの研究室、ゼミのようなものです。主に大学の医学部、歯学部や大学病院において、その診療科や研究室ごとのグループ単位の組織のことを指します。理系の大学もよく研究室の教授から、就職先を紹介してもらうのと一緒です。
医局の頂点には、もちろん絶対的な教授がいます。その長である教授が全ての人事権を握っている場合もあります。医師の転職の場合は、配属や異動などは基本的に人事権を持っている教授が決めます。そのため、医科大学や歯科大学附属病院では、雇用主である、大学側ではなく、医局の教授に人事の決定権があります。そして、その人事自体が、当人の意向を無視したり、教授の独断と偏見で決められてしまうという状況が問題とされていました。
さらに教授は人事権だけでなく、医療機器の導入などで、利権が絡んでくることもあるため、批判の対象とされています。厚生労働省が2004年に新研修医制度を導入し、医局制度の害を無くすために努力をしてきました。結果として、権力自体は小さくなりつつあります。しかし医師を目指すものが、医局の制約がなくなったため、自由に転職をすることができるようになり、過疎地の診療施設などの医師不足が新たな問題となりつつあります。